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2018/05/13 思考研究

Posted by WangXiaoDong on May 13, 2018
    今天,腾飞邀请一堆朋友来我们所食堂吃饭,大家吃的非常愉快!

今天,总结一下层次聚类的评价问题。层次聚类根据结果计算其对应的共表性相关系数(Cophenetic Correlation Coefficient)进行评价。共表相关系数越大,表明效果越好。

下面是计算共表相关系数的API

Y = scipy.spatial.distance.pdist((X,'cityblock');    #计算距离列表
Z = hierarchy.linkage(Y,'average');    #进行层次聚类
cluster.hierarchy.cophenet(Z,Y)  #计算共表相关系数

Z的方式如下:

如下的距离矩阵: 原始数据

变为如下方式的距离列表,即Y

距离列表

参考:这里)